阿里山森林鐵路為世上僅存的三條登山鐵路之一。昔日為轉運木材而建，如今蛻變成森林旅遊列車。園區內現有三條支線，其中「祝山線」為國人自建的第一條高山鐵路，專供前往祝山觀日出的遊客搭乘。「眠月線」為觀光之用，除了沿途美景以外，終點還有著名的石猴遊憩區(目前因921地震毀損尚在維修中暫不開放)。「神木線」則穿越園區，至巨木參天的神木區。而早年所遺留下來的蒸汽火車與報廢車廂，在沼平車站旁裝璜成風味獨特的車廂旅館與火車展示區，讓遊客住宿與觀賞。